A segunda edição do TEMAS ocorreu de 8 a 12 de Abril de 2006, tendo como área temática o conceito Soberania. Durante os cinco dias de evento, foram simulados oito comitês – sendo três em português e cinco em inglês: As Negociações de Münster e Osnabrück, discutindo a Paz de Vestfália, em 1648; O Conselho de Ministros do Império do Brasil, debatendo sobre a Guerra do Paraguai em 1868; A I Comissão da Conferência Monetária das Nações Unidas, que escreveu a Carta do Fundo Monetário Internacional em Bretton Woods, em 1944; o Gabinete Israelense e o Comitê Executivo da Organização para a Libertação da Palestina, ambos deliberando simultaneamente sobre o cerco a Beirute em 1982; o Conselho do Atlântico Norte, órgão máximo da Organização do Tratado do Atlântico Norte, debatendo sobre a situação do Kosovo em 1999; o Conselho de Segurança das Nações Unidas, discutindo sobre a situação na Geórgia, em 2006; e, por fim, a Subcomissão para a Promoção e Proteção dos Direitos Humanos das Nações Unidas, tratando da criação do Conselho de Direitos Humanos, também em 2006.
Além da produção dos Guias de Estudo de cada comitê, os diretores e assistentes da segunda edição do TEMAS também escreveram artigos científicos relacionados ao tópico de seus respectivos comitês e à área temática do evento, soberania. Esses artigos foram compilados e organizados pelos coordenadores do evento e publicados num livro, intitulado “Soberania: Casos e Abordagens”.
Em sua segunda edição, o TEMAS contou com a participação de mais de 100 delegados, vindos das mais diversas regiões do Brasil e, inclusive, alguns participantes estrangeiros. Adicionalmente, houve diversidade na própria equipe do modelo. Ela foi composta, em sua maioria, por alunos de Relações Internacionais da PUC Minas, mas também contou com alguns universitários de outras instituições de Ensino Superior do Brasil, que compartilharam a diretoria de alguns comitês com alunos da PUC.
Paralelamente aos debates de cada comitê, o TEMAS promoveu um espaço de discussão para os organizadores e participantes dos principais modelos brasileiros, no qual conversou-se sobre o futuro das simulações no Brasil. Além das atividades de cunho acadêmico, o TEMAS organizou, ainda, festas e atividades culturais, durante as quais os participantes tiveram a oportunidade não apenas de se divertir, como também de desfrutar da culinária tipicamente mineira.